Шарын биосфералық резерватының аумағы Шарын өзенінің бассейнінде орналасқан және Қазақстанның оңтүстік-шығысындағы Іле тауаралық ойпатының орталық бөлігіндегі ерекше биогеосистема болып табылады. Резерват Шарын өзенінің каньон тәрізді аңғарын реликті шаған орманымен біртұтас тұтасады, шөл жерімен шектескен, экзотикалық рельефі бар және Үлкен-Бөгеті тауларындағы орталық-азиялық типтегі таулы дала аудандарымен ерекшеленеді.
Аумақтың бірегей географиялық ерекшелігі - Қытай мен Монғолияда таралған өте құрғақ шөлдердің экожүйелері бөліктерінің енуі. Түрлі климаттық және орографиялық жағдайлардың үйлесуі жергілікті экожүйелердің бірегей кешенін қалыптастыруға негіз болды; ландшафт пен биологиялық әртүрліліктің біртектілігі сонымен қатар оның Орталық және Ішкі Азия шөлдерінің Жоңғария мен Тұран түрлерінің арасындағы Азия субконтинентінің үлкен биогеографиялық шекарасында орналасуына байланысты. Жалпы алғанда, Шарын биосфералық резерватында жаратылыстағыдай және табиғи жүйенің барлық биологиялық және геологиялық компоненттерінің бірегей және ерекше кешені сақталған.
Резерват өсімдік тұқым материалының табиғи өндірісі арқасында шөлейттенудің және жердің тозуының дамуын болдырмайтын, төңіректегі бұзылған жайылымдарда өсімдіктердің табиғи қалпына келуінде үлкен оң рөл атқарады. Шарын өзеннің бүкіл алқабы, Кетмен жотасының оңтүстік беткейінде Шәлкөдесу бастауынан басталып, Іле өзеніне құятын атырауымен аяқталады, ондағы жануарлар мен өсімдіктердің ең бай ресурстары ұзақ уақыттан бері адамның тіршілік ету ортасы болып келеді. ХХ ғасырда халық негізінен егіншілікпен айналысты: астық шаруашылығы және мал шаруашылығы, сонымен бірге аң аулау, ағаш кесу және ағаш өңдеу. Сонымен, өткен ғасырдағы ең үлкен әсер шөл, дала және орман ландшафттарына әсер етті. Алайда ірі мал фермаларының болмауы және геоморфологиялық құрылымның ерекшеліктері қорықтағы өзендердегі судың тазалығына оң әсер етеді. Мұның бәрі тұтастай алғанда аумақтың ландшафты мен биологиялық әртүрлілігін сақтауға мүмкіндік береді.
Шарын биосфералық резерватының жалпы ауданы – 239 731 га. Негізгі аймақ 9427,5 га, буферлік аймақ - 117 622,5 га, өтпелі аймақ - шамамен 112 681 га.
Барлық негізгі және буферлік аймақтар Шарын мемлекеттік ұлттық табиғи паркінің аумағына сәйкес келеді. Шарын мемлекеттік табиғи ұлттық паркі ХТҚО табиғи аймақтарының ең жоғары санатына (A1) сәйкес келеді.
Негізгі биосфералық резерват аймағының ауданы 9427,5 га құрайды. Негізгі бөлігіндегі биосфералық резерваттың биіктік шекаралары 350-ден 1800 метрге дейін өзгереді.
Биосфералық резерваттың негізгі аймағы - Үлкен және Кіші Бөгеті таулары мен Шарын шатқалын қоса Іле өзенінің бассейнінің орталық бөлігіндегі табиғи тау кешені болып табылатын Шарын мемлекеттік ұлттық табиғи паркінің табиғи қорық режимінің қатаң қорғалатын аймағы.
Буферлік аймақ ерекше қорғалатын табиғи аумақтардың қолайсыз әсерінен қорғау үшін осы аймақтағы жағдайға және осы аймақтағы экожүйелерді қалпына келтіруге әсер ететін кез-келген әрекетке тиым салумен құрылған. Буферлік аймақтың ауданы - 117 622,5 га.
Шарын биосфералық резерватының өтпелі аймағы (даму аймағы, ынтымақтастық) Алматы облысының Ұйғыр, Еңбекшіқазақ және Райымбек әкімшілік аудандарының аумағында орналасқан. Өтпелі аймақтағы жердің жалпы ауданы шамамен 112 681 га құрайды.
Негізінен пайдаланылатын жерлер жайылымдарға, басқа жерлерге жатады, ал шабындық жерлер азырақ. Шаруа қожалықтары негізінен ұсақ және ірі мүйізді малдарды бағуда, дәнді дақылдар (арпа, жүгері, күнбағыс және т.б.) аз мөлшерде өсіріледі. Мал жайылатын жерлерде бірнеше ондаған қой қоралары бар, олар негізінен мал ұстауға арналған. Резерват аумағындағы жол инфрақұрылымы негізінен кордондар арасындағы топырақ жолдардан тұрады. Елді мекендердің жерлерінде Шонжы ауылын Алматы мегаполисімен байланыстыратын қоғамдық асфальт жол бар. Қорықтың орталық ғимараты және негізгі инженерлік коммуникациялар мен ғимараттар Шонжы ауылында орналасқан.
Биосфералық резерваттың орталық базасы телефон байланысы, электр энергиясы, ағынды су, жергілікті канализация және жылумен қамтамасыз етілген. Резерваттың инженерлік инфрақұрылымымен қамтамасыз ету аяқталмаған, бұл көптеген электр қуатымен қамтамасыз етілмеген кордондарға қатысты. Кордондердің көпшілігі электр энергиясына қажеттілікті қанағаттандыру үшін электр генераторларымен қамтамасыз етілген.
Шарын биосфералық резерват территориясының флористік әртүрлілігіне 426 туысқа және 90 тұқымдасқа жататын жоғары тамырлы өсімдіктердің 1000-ға жуық түрі кіреді, бұл Қазақстан флорасының 18% құрайды (5600 түрі). Бұл резерват аумағының едәуір флористік байлығымен расталады, бұл әртүрлі флора түрлерінің Шарын өзені бойымен өтетін Тұран мен Жоңғарияның шөлдері арасындағы үлкен ботаникалық-географиялық шекараның өзара араласуына байланысты. Салыстыру үшін біз табиғи жағдайға ұқсас аймақтардың флорасы туралы мәліметтерді ұсынамыз, мысалы, биосфералық резерват аумағынан 5 есе асатын Шу-Іле тауларында тек 823 түрі бар. Тарбағатай жотасы, аумағы дерлік 20 есе үлкен, резерваттың өсімдіктерінен тек 2 есе асады. Кеңейту аймағының флорасында көптеген реликті және эндемиктік, көбінесе жүйелі түрде оқшауланған түрлер бар. Мұнда көптеген сирек кездесетін және құрып кету қаупі төнген өсімдіктердің мекендейтін жерлері сақталған, олардың көпшілігі Қызыл кітапқа енген.
Шарын биосфералық резерватының фаунасы бай және алуан түрлі. Мұнда құйрықсыз қосмекенділердің 4 түрі мекендейді, бұл Қазақстанның батрахофаунасының 33% құрайды. Олардың екеуі – Даната құрбақасы және сібір бақасы - Қазақстанның Қызыл кітабына енгізілген (1996). Бауырымен жорғалаушылардың ішінде 10 түрлі кесірткелер мен 8 жыландар түрлері кездеседі, бұл республикадағы бауырымен жорғалаушылар фаунасының 36,7% құрайды, шұбар батбат Қазақстанның Қызыл кітабына енгізілген. Орнитофаунада құстардың 236 түрі тіркелген (Қазақстанның авиафаунасының 48,4%), олардың 130 түрі ұя салады, оның ішінде 22 түрі Қазақстанның Қызыл кітабына енгізілген. Қорықта сүтқоректілердің 32 түрі мекендейді. Тағы 15 түрді кең аймақта кездестіруге болады. Екі түрі Қазақстанның Қызыл кітабына енгізілген (қарақұйрық пен сабаншы). Сонымен, Шарын биосфералық резерватының аумағы типтік зооценоздар мен жануарлардың түрлерінің сақталуы үшін үлкен маңызы бар. Бауырымен жорғалаушылар, құстар мен сүтқоректілердің аталған түрлерінің жартысына жуығы Оңтүстік-Шығыс Қазақстанның ерекше қорғалатын аймақтарында, оның ішінде Алматы қорығы мен Іле Алатауы ұлттық паркінде кездеседі, олар биік таулы ландшафттарды алып жатыр.
Шарын БР аумағы мен оған іргелес жатқан аудандардың табиғи жағдайы әртараптандырылған ауылшаруашылығы мен туризмді дамыту үшін өте әртүрлі. Белгілі табиғи ескерткіштер бар - Еуразиядағы жалғыз (Канададан кейінгі екінші) ауданы 5,0 мың га болатын реликті шаған тоғайы және Қазақстандағы Шарын мен Темірлік өзендерінің әйгілі шатқалдары. Реликті тоғайдың пайда болуы палеоген дәуіріне жатады. Бұл – үштік мұздық кезең аяқталғаннан бері сақталған ерекше табиғи ескерткіш. Ескерткіштің негізін қазіргі заманғы флораның ежелгі түрлерінің бірі - ХТҚО халықаралық критерийлері бойынша жойылып кету қаупі төнген түрлерге жатқызылған соғды шағаны құрайды. Ұлы Жібек жолының қазақстандық бөлігі аймақ арқылы өтеді. Жаркент қаласында бірегей сәулет-өнер мұражайы «Жаркент мешіті» бар. Қазіргі уақытта бұл бағыт Қазақстан мен Қытай арасындағы сауда-экономикалық қатынастардағы маңызды бағыттардың бірі болып табылады. Бұл табиғи, тарихи және сәулет нысандары Қазақстанның оңтүстігі мен оңтүстік-шығысында туристік кластердің бір бөлігін құруға негіз болып табылады. Бұл кластерді Шарын биосфералық резерватының мүмкіндіктері және туризмнің әртүрлі типтері мен санаттарын: экологиялық, этникалық, мәдени, ғылыми, рекреациялық, Оңтүстік-Шығыс Қазақстанның бүкіл аймағының жалпы экономикалық дамуы жағдайында толықтыруға болады.
Болашақта қорықтың аумағында шарап кластерін құрып, технологиялық процестерде және контейнерлерді, тауарлық белгілерді, қаптама материалдарын және т.б. шығаратын қосалқы өндіріс орындарында қосымша байланыс орнатқан жөн. Сондай-ақ, жылу көздерінен жылу энергиясын пайдалануға негізделген жылыжайларды құру аймақ үшін өте тиімді болуы мүмкін. Жылыжай фермалары көп жағдайда Алматыны Шонжы-Алматы жолының сапасы жақсарған жағдайда жаңа көкөністермен қамтамасыз ету мәселесін шешеді. Резерваттың жанында Батыс Еуропа - Батыс Қытай автокөлік жолының құрылысы (Ұйғыр облысының аумағында ұзындығы 150 км) жүргізілуде, оның жалпы сметалық құны шамамен 17-20 млрд. теңгеге бағаланады. Бұл бүкіл аймақтың дамуына, сондай-ақ тас жолға іргелес жатқан елді мекендерге де серпін беретіні сөзсіз.