Катон-Қарағай БР жалпы ауданы - 1 050 477 га. Негізгі аймағы 643,477 га, буферлік аймақ - 50 000 га (периметр жолағының 2-3 км), даму аймағы - 400 000 га құрайды.
БР-нің негізгі аймағы - Алтайдың таулы табиғи кешені болып табылатын Катон-Қарағай мемлекеттік табиғи ұлттық табиғи паркінің қорғалатын режимінің қатаң қорғалатын аймағы. Қазақстан Республикасының «Ерекше қорғалатын табиғи аумақтар туралы» Заңының 6-тармағына 28-тарауына сәйкес, мемлекеттік табиғи резерват дегеніміз - экологиялық және ғылыми мекеме мәртебесі бар ерекше қорғалатын табиғи аумақ, оның мақсаты табиғи процестер мен құбылыстардың, флора мен фауна объектілерінің, өсімдіктер мен жануарлар дүниесінің табиғи бағытын сақтау және зерттеу, өсімдіктер мен жануарлардың түрлері мен қауымдастықтары, типтік және ерекше экологиялық жүйелер және оларды қалпына келтіру болып табылады. Ерекше құнды экологиялық жүйелер мен объектілерді қамтымайтын арнайы бөлінген учаскелерде уәкілетті орган белгілеген тәртіппен реттелетін экологиялық туризмді жүргізуге арналған экскурсиялық трассалар мен маршруттар құруға жол беріледі (32-бап). Катон-Қарағай мемлекеттік табиғи паркі Халықаралық табиғатты қорғау одағының ең жоғары санатына (A1) сәйкес келеді. Биосфералық резерваттың негізгі қорғалатын аймағының ауданы 643 477 га құрайды.
Негізгі аймақ тұтас аймақты білдіреді. Негізгі бөлігіндегі биосфералық резерваттың биіктік шекаралары 2000 - 4506 м аралығында (Белуха қаласы). Оңтүстік бөлігі - 850 м-ден (Бұқтырма өзенінің аңғары), 3487 м-ге дейін (Оңтүстік Алтай жотасы). Белуха ауданындағы салыстырмалы биіктіктер 2500-3000 м-ге жетеді.
Катон-Қарағайдың БР буферлік аймағы Қазақстан Республикасының заңнамасына сәйкес қорықтың қорғалатын аймағы болып табылады, ол ядро аймағының периметрі бойынша екі-үш шақырым жолақты қамтиды. «Ерекше қорғалатын табиғи аумақтар туралы» Қазақстан Республикасы Заңының 23-тармағы бойынша, ерекше қорғалатын табиғи аумақтардың айналасындағы қолайсыз сыртқы әсерлерден қорғау үшін қорғау аймақтары құрылады, осы аймақтардың ішінде осы аумақтардың экожүйелерін қалпына келтіруге және қалпына келтіруге теріс әсер ететін кез-келген әрекетке тиым салынады. БР аумағында буферлік аймақтың жерлері негізгі жер пайдаланушылардан алынбаған, олар ауыл шаруашылығы жерлерінен тұрады және ауылшаруашылық ұйымдары мен жеке тұлғалардың қарауында. Қорғалатын аймақтың жекелеген учаскелерінде шаруашылық қызметті жүргізу (шөп дайындау, мал жаю) мемлекеттік уәкілетті органмен келісім бойынша және ҚР табиғи резерваты әкімшілігінің бақылауымен жүзеге асырылады. БР буферлік аймағының аумағында экологиялық білім беру, демалыс, экотуризм, сонымен қатар ғылыми зерттеулер жүзеге асырылады. Аралық аймақтың ауданы - 50 000 га.
Катон-Қарағайдың өтпелі аймағы (даму аймағы, ынтымақтастық) Шығыс Қазақстан облысының Катон-Қарағай әкімшілік ауданының аумағында орналасқан. Өтпелі аймақтың жалпы жер көлемі шамамен 400 000 га құрайды.
Катон-Қарағай табиғи паркіне апаратын негізгі автокөлік жолдары: 1) батыс жағынан, қазақстандық жағынан - республикалық маңызы бар Өскемен –Үлкен нарым ауылы – Катон-Қарағай - с. Урыл - Рахманов кілттер ауылынан Урыл ауылына дейін жақсы асфальт төселген тас жолы бар. Содан кейін қиыршық бетті жол бар. Сол жол жақын маңдағы Зубовка (Зыряновск қаласы) теміржол вокзалы мен Катон-Қарағай ауылындағы жергілікті әуежайды байланыстырады. Өскеменнен Урыл ауылына дейінгі арақашықтық 417 км. Урыл ауылынан Рахманов кілттері курортына дейін - 45 км. 2) облыстық автокөлік жолына Катон-Қарағай - Коробиха - 45 км жатады; Пештер - Ақ - 24 км.
КҚМҰТП-ке жақын 7 ауылдық округ бар:
Ақсу ауылдық округі: Ақсу ауылы, Верх-Катун ауылы, Фыкалка ауылы, Чаловка ауылы;
Жамбыл ауылдық округі: Жамбыл ауылы, Рахманов кілттері ауылы, Қараайрық ауылы, Шұбарағаш ауылы, Берел ауылы, Маралды ауылы;
Белқарағай ауылдық округі: Белқарағай ауылы, Топқайың ауылы, Өрнек ауылы, Согорное ауылы;
Катонқарағай ауылдық округі: Катонқарағай ауылы, Мойылды ауылы, Жаңаүлгі ауылы, Шыңғыстай ауылы, Қабырға ауылы;
Коробихин ауылдық округі: Коробиха ауылы, Печи ауылы, Черемошка ауылы;
Урыл ауылдық округі: Урыл ауылы, Аршаты ауылы, Еңбек ауылы;
Черновин ауылдық округі: Черновая ауылы, Ақмарал ауылы, Қызылжұлдыз ауылы, Қайыңды ауылы.
БР әкімшілік орталығы 18 ғасырдың аяғында құрылған Катон-Қарағай ауылында орналасқан.
Қазіргі демографиялық жағдай қолайсыз деп бағаланады және жалпы аймақта, сонымен қатар Катонқарағай ауданында халық саны азайып келеді.
Серіктестердің тиісті шеңберін тарту үшін Катон-Қарағай БР үйлестіру кеңесі құрылды, оның құрамына мемлекеттік табиғи ұлттық парктің өкілдері, табиғат пайдаланушылар, жергілікті билік органдары және қоғамдық ұйымдар кіреді.
Қазақстан Республикасының заңнамасына сәйкес, БР буферлік аймағының жекелеген аудандарындағы шаруашылық қызметті басқару (шөп дайындау, мал жаю) Мемлекеттік уәкілетті органмен келісім бойынша және мемлекеттік табиғи ұлттық табиғи парк әкімшілігінің бақылауымен жүзеге асырылады, барлық даулы мәселелер БҚ Үйлестіру Кеңесінің отырыстарында шешіледі.
Шығыс Қазақстан облысы Катон-Қарағай ауданы әкімінің мемлекеттік табиғи резерваттың шекарасы бойымен 2-3 шақырымдық буферлік аймақ құру туралы қаулыларын дайындау барысында қорықтың буферлік аймағының жерлерінде бірлескен іс-шаралар туралы барлық табиғат пайдаланушылармен келісімдер жасалды. Жеке меншіктегі буферлік аймақтың жер учаскелері жер пайдаланушылардан алынбаған.
Қазіргі уақытта Катонқарағай мемлекеттік табиғи ұлттық табиғи паркін басқару жоспары бар, онда БР негізгі және буферлік аймақтарын басқаруға қатысты. Табиғат пайдаланушылардың қорықтың басқару жоспарына сәйкес келетін жеке басқару жоспарлары бар. Нәтижесінде, барлық осы жоспарлардың қарапайым үйлесімі іс жүзінде БР бүкіл аумағын басқарудың бас біріктірілген жоспары болып табылады. Өтпелі аймақ жайлы БР-дің арнайы басқару жоспары әлі жасалынған жоқ, ол БР дамуының осы кезеңінде қажет емес. Барлық даулы мәселелер БР Үйлестіру Кеңесінің отырыстарында шешіледі.
БР басқару 2012 жылы құрылған Катон-Қарағай БР үйлестіру кеңесі арқылы жүзеге асырылады. Бұрын бүкіл аумақты басқару саябақтың ғылыми-техникалық кеңесі арқылы жүзеге асырылған (2012 жылдың қыркүйегіне дейін). Үйлестіру кеңесі алқалы мемлекеттік орган болып табылады және БР ресурстарын тиімді басқару және орнықты пайдалану, баламалы іс-шараларды, ресурстарды үнемдейтін және жаңартылатын технологияларды енгізу саясатын енгізу мақсатында құрылды. БР үйлестіру кеңесіне мемлекеттік органдардың (орман және аңшылық шаруашылығы аумақтық басқармасы), қорықтың, әкімдіктердің, жергілікті үкіметтік емес ұйымдардың және жер пайдаланушылардың өкілдері кіреді, сонымен бірге барлық табиғи ресурстарды пайдаланушылар арасындағы ынтымақтастықты қамтамасыз ету және қайшылықтарды жеңу үшін қажет.
БР аумағында қазіргі кезде табиғи кешендердің жай-күйі мен сақталуының мониторингі, сонымен қатар сирек кездесетін және құрып кету қаупі төнген түрлерге мониторинг жүргізілуде, популяция жағдайын анықтау, жануарлар мен өсімдіктердің сирек кездесетін түрлері экологиясының ерекшеліктерін нақтылау, бұл түрлердің сақталуы мен қалпына келу перспективаларын бағалауға мүмкіндік береді. Мониторингтің мақсаты - БР аумағындағы өсімдіктер мен жануарлардың жай-күйі, сондай-ақ олардың тіршілік ету ортасы туралы тұрақты объективті мәліметтер алу. Мониторинг мәліметтері негізінде популяциялар мен экожүйелердің жай-күйін, БР жұмысының тиімділігін, сондай-ақ дағдарыстық жағдайлар мен жағымсыз құбылыстардың алдын алу (жою) жөніндегі шараларды әзірлеу қажет. Мониторинг аясында «Табиғат шежіресі», сонымен қатар сүтқоректілердің, құстардың және омыртқасыздардың санын есептеу жүргізілуде.
Басқару жоспарына сәйкес қазіргі уақытта мемлекеттік табиғи-қорық қорының объектілерін түгендеу және зерттеу, сондай-ақ табиғи процестер мен табиғи мониторингтің табиғи барысын зерттеу бойынша ғылыми зерттеулер жүргізілуде. Бұл ғылыми жұмыстарға «Табиғат шежіресі» бағдарламасы бойынша құбылыстар мен процестерді бақылау, флора мен өсімдіктерді түгендеу, сирек кездесетін және құрып кету қаупі бар омыртқалылар мен омыртқасыздарды зерттеу, биоәртүрлілік пен индикатор түрлерінің популяцияларының жай-күйін бақылау кіреді.
БҰҰДБ / ҒЭҚ екі жобасының (Батыс Алтайдың биоалуантүрлілігін сақтау) қолдауымен кадрларды даярлау және дамыту үшін мемлекеттік табиғи қорықтың қызметкерлері Қорғалжын биосфералық қорығына, Қаратау қорығына (Қазақстан), Березинск қорығына (Беларусь), «Қорықтар» экологиялық орталығына (Мәскеу, Ресей) тәжірибе алмасуға кетті, сонымен қатар Қазақстанда және шетелде ғылыми-практикалық конференцияларға (Минск, Беларусь) қатысты. 2009-2011 жылдары резерват қызметкерлері үшін басқару жоспарын дайындау, биоәртүрлілік мониторингі, инспекторларды хаттамаларды ресімдеу және қауіпсіздік техникасы мен өрт қауіпсіздігі ережелерін сақтау бойынша оқыту бойынша семинарлар өткізілді.
Катон-Қарағай БР өзеннің жоғарғы ағысында орналасқан. Бұқтырма, Ақ және Қара Берел, Листвяга мен Катун жоталарының оңтүстік беткейлері (Белуханың шығыс шыңымен), Бұқтырма өзенінің сол жағалауындағы жоталар: Сарымсақты, Тарбағатай (Оңтүстік Алтай) және Оңтүстік Алтай. Катун жотасының бір бөлігін қосқанда солтүстік бөлігі 2000-4506 м аралығында абсолютті биіктікке ие (Белуха қаласы). Оңтүстік бөлігі - 850 м-ден (Бұқтырма өзенінің аңғары), 3487 м-ге дейін (Оңтүстік Алтай жотасы). Белуха ауданындағы салыстырмалы биіктіктер 2500-3000 м-ге жетеді. Альпілік рельеф: айқын аңғарлармен, жартасты таулармен, мореналармен. Дәл сол рельеф сипаты Оңтүстік Алтай жотасының шығыс бөлігінде байқалады. Ұлттық саябақтың қалған бөлігі, соның ішінде Сарымсақты, Тарбағатай және Листвяга жоталары, негізінен, тегіс тау рельефіне ие.
Биік тау нивальды аймағы - өсімдіктер топтары жұқа топыраққа қоныстанады. Өсімдік жамылғысы мұздықтың кешенді өсімдіктерімен (төмен омалотека, әдемі пиретрум, вальдхемия, қаражидек, қар наурызгүлі, төмен ұлпабас, Алтай сарғалдағы және т.б.) түзіледі. Субнивальды белдеуде өсімдіктің екі түрі ерекше ерекшеленеді: жартас пен шөгінді тастары. Жартастарда бұталардан сібір бөріқарақаты, қара қарақат және хош иісті қарақат белгілі. Шөптесін өсімдіктердің құрамы әртүрлі. Бұталар тасты аралас топырақтар мен шөгінділерде орналасқан: алтай үшқаты, жалған казак аршасы, мирта талы, ал шөптесін өсімдіктер арасында алатау кестежусаны, Крылов кестежусаны, альпі термопсисі, керемет беде және т.б.
Биік тау тундра-шалғынды аймағы. Тасты немесе шақпақ тасты-қыналы тундрада негізгі рөлді қынаның Cetraria, Cladonia, Parmelia, Peltigera, Stereocaulon туыстары алады. Жоғары гүлденетін өсімдіктер алуантүрлі, басым түрлері - Беллард және К.Смирнов доңызсырты, ал сонымен бірге басым кездесетіндер қияқтар мен моңғол сұлыбасы.
Саябақтың аумағында шөпті тундраның түзілімдері бар: қияқты-астық тұқымдасты тундраның басым түрлері – оңтүстік-сібір тиынтағы, альпілік термопсис, суық көкгүл және басқа өсімдіктер. Беллард доңызсырты көбінесе доңызсыртты тақыршақ шалғындарда басым кездеседі. Аратіс дарабас немесе бұлдырық оты дриада тундраларында басым кездеседі.
Таулы-шалғынды альпілік белдеуде 100-120-ға жуық флора түрлері кездеседі. Ашық гүлденетін түрлер басым болады, бұл шалғындарға олардың түрлі-түстігін береді.
Таулы-орманды аймақ - саябақтың орман ресурстарына бай аймағында орналасқан. Мұндағы ормандар шаруашылық белсенділікке байланысты аздап өзгерген және орман өрттерінен аз шығын алған. Орман қорын мемлекеттік есепке алу деректері бойынша орманды алқап 216184 га құрайды. Оның 80% -ға жуығы қылқан жапырақты ормандар, 19% -ы бұталар және 1% -дан сәл ғана көбі жапырақты ормандар.
Шабындық шөптер мен гүлдерде жоғары тамырлы өсімдіктердің 1000-нан астам түрі, сондай-ақ мүк, қыналар мен саңырауқұлақтар кездеседі.
Қазақстандық Алтайдың флорасына 131 тұқымдас 693 туыстыңе 2450 түрі кіреді, оның ішінде: Оңтүстік Алтай - 2052 түрі (Қазақстан Алтайының барлық түрлерінің 83,8%) 608 туыс (87,7%) және 116 тұқымдас (88,5%). Катонқарағай БР аумағында 78 тұқымдастың 1000-ға жуық өсімдік түрі өседі, олардың 30-ы Қазақстанның Қызыл кітабына енгізілген. Түрлерге бай тұқымдастар: астық тұқымдастар (Poaceae), күрделігүлділер (Asteraceae), раушангүлділер (Rosaceae), сарғалдақ тұқымдастар (Ranunculaceae), бұршақ тұқымдастар (Fabaceae), қияқтар (Сурeraceae), қалампырлар (Caryophyllaceae).
Катон-Қарағай БР Шығыс Қазақстан облысының Катон-Қарағай әкімшілік ауданының аумағында келесі шекараларда орналасқан:
Солтүстік және шығыс: Ресеймен шекаралас (Алтай Республикасы)
Оңтүстік-шығыс: Қытай Халық Республикасымен шекаралас
Батыс: Белқарағай және Солдатово ауылдарына дейін
Оңтүстік: Оңтүстік Алтайдың солтүстік беткейлері: Сарымсақты, Тарбағатай, Нарым - Шыңғыстай орман шаруашылығының Мұз-Бел орман саяжайының шекарасы және Катон-Қарағай мен Күршім аудандарының әкімшілік шекарасы бойымен шығыста Қытаймен шекаралас.
БР аумағының солтүстіктен оңтүстікке дейінгі ұзындығы шамамен 60 км, батыстан шығысқа қарай 150 км құрайды. Мекемеге әмбебап мирасқорлық тәртiбiмен Берел және Катон-Қарағай мемлекеттiк мекемелердің орман және жануарлар дүниесiн қорғау жөнiндегi мемлекеттiк мекемелерiне тиесiлi 515,538 га жер учаскелерiн тұрақты пайдалану құқығын бердi, сонымен қатар, Шығыс Қазақстан облысы Катон-Қарағай әкімшілік ауданының резервтік жерлерінен жалпы алаңы 127,939 га жер учаскелері тұрақты жер пайдалануға берілді. БР жалпы ауданы 643,477 га құрайды.
БР аумағынан әдістемелік нұсқаулар мен нұсқауларға сәйкес ірі елді мекендер, ауылдық округтердің жерлері, малды айдау жолдары, көлік тораптары мен артериялар алынып тасталды. МҰТП орталық кеңсесі Катон-Қарағай ауылында,ол облыс орталығынан 90 км қашықтықта (Үлкен Нарым ауылы) және облыс орталығынан 350 км қашықтықта (Өскемен қаласы) орналасқан.
Катон-Қарағай БР-на апаратын негізгі жолдар:
1) Батыс және Қазақстан жағынан республикалық маңызы бар Өскемен - Үлкен Нарым – Катон-Қарағай ауылы - Урыл ауылы - Рахманов кілттері ауылынан автокөлік жолдары бар, Урыл ауылына дейін жақсы асфальт төселген.
Бұл жол жақын маңдағы Зубовка (Зыряновск қаласы) теміржол вокзалы мен Катон-Қарағай ауылындағы жергілікті әуежайды байланыстырады.
Өскеменнен Урыл ауылына дейінгі арақашықтық 417 км. Урыл ауылынан Рахманов кілттері шипажайына дейін - 45 км.
2) Катон- Қарағай - Коробиха - 45 км автокөлік жолы облыстық жолға жатады; Пештер - Ақ - 24 км.
Қазіргі уақытта БР аумағындағы негізгі ғылыми-техникалық қолдауды Катон-Қарағай мемлекеттік табиғи ұлттық табиғи паркі көрсетеді. ҒЭҚ / БҰҰДБ «Алтай биоәртүрлілігін сақтау» халықаралық жобасы аясында (2005-2011 жж.) материалдық-техникалық база нығайтылды және көптеген оқыту семинарлары өткізілді. Ұлттық парктің әкімшілігі жыл сайын түрлі фестивальдер мен байқаулар (саябақ шеруі, құстар мерекесі, балалар шығармашылығының конкурстары және т.б.) ұйымдастырады. Ұлттық парк құрылғаннан бері көптеген диорамалар мен мұражай экспонаттары бар бірнеше көрме залдарын алатын табиғат мұражайы жұмыс істейді.
Техникалық базаны жетілдіру аясында 2005-2011 жж. ҒЭҚ / БҰҰДБ жобалық жабдықтарының бір бөлігі (автомобильдер, компьютерлер және басқа да кеңсе жабдықтары, судың сапасын бақылау құрылғылары, камералар, бейнекамера, жаңғырық орнатқыш, бинокль, телескоп, GPS және т.б.) сыйға тартылды. 2005-2011 жылдары жоспарланған жұмыстардың аясында басқару жоспарын дайындау, биоәртүрлілікті бақылау, мемлекеттік инспекторларды хаттамаларды рәсімдеу тәртібіне оқыту, қауіпсіздік және өрт ережелерін сақтау бойынша оқыту, «Қорғалжын» биосфералық резерватында, Қаратау қорығында (Қазақстан), Березинск қорығында (Беларуссия) тәжірибе алмасу мақсатында іссапарлар ұйымдастырылды, сондай-ақ Қазақстанда (Алматы, Астана) және шетелде (Мәскеу, Ресей және Минск, Беларуссия) ғылыми-практикалық конференцияларға қатысты.
Бұқтырма, Ақ және Қара Берел өзендерінің жоғарғы ағысындағы территория, Листвяга мен Катун жоталарының оңтүстік беткейлері (Белуханың шығыс шыңымен), Бұқтырма өзенінің сол жағалауындағы жоталар: Сарымсақты, Тарбағатай (Оңтүстік Алтай) және Оңтүстік Алтай биосфералық резерваттың аумағы. Катун жотасының бір бөлігін қосқанда солтүстік бөлігі 2000 - 4506 м аралығында абсолютті биіктікке ие (Белуха қаласы). Оңтүстік бөлігі - 850 м-ден (Бұқтырма өзенінің аңғары), 3487 метрге дейін (Оңтүстік Алтай жотасы). Белуха қаласы ауданындағы салыстырмалы биіктіктер 2500-3000 метрге жетеді.
БР аумағында биік таулы төрт аймақ бар, оларға аймақтың барлық ландшафттары кіреді:
I. ниваль субнивальды белдікті қамтиды;
II. тундра-шалғынға 3 белдеу кіреді: тау-тундра, таулы-шалғынды-альпі және таулы-шалғынды-субальпілік;
III. тау-орман 2 белдеуден тұрады: тау-орман субальпі, таулы-шалғынды тайга;
IV. тау-орман-шалғынды-дала.
Биік таулы нивальды аймақ - бұл жерден таңғажайып көрініс ашылады, мұздықтардың ақтығымен және тау өзендерімен кесілген терең шатқалдары бар қарлы тау шыңдарымен ерекшеленетін қуатты таулар. Бұл аймақтың төменгі шекарасы теңіз деңгейінен шамамен 2800 м биіктікте орналасқан, өсімдіктер тау жыныстарындағы жарықтарда және тасты қабаттардағы тастардың арасында, сондай-ақ мұздықтар мен қарлы аймақтардың беткейлерінде жиналады. Бұл аймаққа фрагменттер мен шөптесін өсімдіктердің альпілік түрлерінен тұратын фрагментті өсімдіктер қауымдастығы тән: қар наурызгүлі, қарлы дәуаяқ, төмен ұлпабас, алтай сарғалдағы. Субнивал аймағында сібір бөріқарақат, қара қарақат және хош иісті қарақат, жалған казак арша, алтай үшқаты, шөптесін өсімдіктерден: етжапырақ бадан, сібір тасжарғаны, қар қазтабаны, сібір патриниясы, безді шөмішгүл және басқа түрлер кездеседі.
Тау-тундралық белдеу, оның жоғарғы шекарасы теңіз деңгейінен 2800 метр биіктікте өтеді, ал төменгісі абсолюттік биіктігі 2100 метрге дейін түседі. Жоғарғы қабатын тасты, мүк-қыналы, бұталы және шөптесінді тундралар, мүктер, алтай қоңыроты, суық көкгүл мен бұталар - дөңгелек жапырақты қайың, тікенді үшқат, тобылғы және тырбық талдар алады.
Таулы-орманды аймақ теңіз деңгейінен 1200-1250 м-ден 2200-2300 м биіктікке дейінгі аралықта таралған. Оған екі белдеу кіреді: жоғарғы позицияны алып жатқан тау-орман субальпісі және оның төменгі жартысында орналасқан таулы шалғынды-тайга. Бұл аймақтың ішінде негізгі орман түзуші түрлері өседі: сібір қарағайы, сағызқарағай, шырша. Шағын аудандарды майқарағай, қайың, терек, көктерек пен талдың ормандары алып жатыр. Шөптер жамылғысы астық тұқымдастар, қияқтар, қаражидектер мен түрлі шөптерден тұрады.
Таулы орманды-шалғынды-дала аймағы сирек сағызқарағайлы және аралас (қайың-сағызқарағай-көктерек) ормандармен сипатталады, онда астық тұқымдасты-шөптесінді және бұталар өседі. Орман жабынының астында және алаңқайларда бұталар кеңінен таралған: сібір аюбадамы, орташа тобылғы, сары қараған, тікенді раушан.
Дәнді дақылдар арасында ең көп таралған кәдімгі тарғақшөп, қарағай қысқа аяқты және айрауық. Түрлі шөптесінді өсімдіктерден - бұл орыс құртқашашы, киікоты, ұзын жапырақты шоқсары, солтүстік қызылбояуы және басқа түрлер кездеседі.
Катон-Қарағай БР - оңтүстік-батыс Алтайдағы биоәртүрлілікті сақтау үшін өте маңызды табиғи кешен. Өсімдіктердің тіршілік формалары орманды, жартылай орманды, шөптесінді өсімдіктерден тұрады.
KҚМҰТП аумағында жүргізілген далалық зерттеулер барысында 28 туыс және 13 тұқымдастыққа жататын ағаштар мен бұталы өсімдіктердің 56 түрі тіркелді, бұл Оңтүстік Алтай флорасының түрлер құрамының 5,4% құрайды. KҚМҰТП орман қорының жалпы ауданы 267 202 га құрайды. Ормандар көбінесе аралас типті, көбінесе басым ағаш түрлерінің құрамы өзгерген кезде шөптер мен мүк қабаттарының құрамы сақталады.
Ұлттық парктің аумағында орманның 40 түрі бар, олардың ішінде балқарағай (20,3%) және сағызқарағай (21,4%) түрлері басым. Орманның бұта тәрізді түрі - субальпілік аласа қайыңы 37,7% алып жатыр.
Балқарағай ормандарының арасында орман түрі басым - шөп балқарағайы - 7,3%, ол теңіз деңгейінен 1500-1700 м биіктікте тау бөктерінің ортаңғы және төменгі бөлігін алады. Қалың аласа ағаштар тобында негізінен қарақат және үшқат бар. Шөптер жамылғысы тығыз - айрауық, қияқ, аюоты, қырықбуын.
Сағызқарағайлы орман типтері ішінде астық тұқымдасты – түрлі шөптесінді сағызқарағайлы орман басым - 12%, ол теңіз деңгейінен 1750-1800 м биіктікте жазық, көбінесе орта тік тау бөктерін алып жатыр, солтүстік-солтүстік-шығыста, сирек солтүстік-батыста және батыста. Өскіндері сирек, итмұрын мен тобылғы жекелеп кездеседі; шөптер жамылғысы жақсы дамыған, айрауық, қысқа аяқты және арпабас басым. Ксерофильді шөптердің қоспасы тән - жусан, құртқашаш, қой бүлдірген.
Бұталардың ішіндегі басым түрі - субальпілік аласа қайың теңіз деңгейінен 2000-2300 м биіктікте кең таралған, рельефтің әр түрлі формаларында: жартасты жазық жоталардан бастап беткейлердің тегістелген және ойыс бөліктеріне дейін. Аласа қайың тундралары барлық тау жоталарында жиі кездеседі.
Жартылай ағашты форма (жартылай бұталар) дерлік барлық жусандар, алабота тұқымдасының көптеген түрлерін және басқа өсімдіктерді қамтиды.
Шөптесін өсімдіктер формасы немесе шөптер - бұл ең көп топ. Көпжылдық шөптер, негізінен ксерофиттер басым.
Катонқарағай БР аумағында сирек кездесетін және құрып кету қаупі бар өсімдіктердің 30 түрі өседі:
Cladoniarangiferina (L.) Harm. – бұғы кладинасы, Diphasiastrum alpinum (L.) Holub – альпі дифазиаструмы, Huperzia selago (L.) Bernh ex Schrank et Mart. – кәдімгі баранец, Adonis vernalis L. – көктемгі жанаргүл, (жанаргүл), Allium pumilum Vved. in Bull. Univer. As. Centr. - аласа пияз, Astragalus glycyphullusL. – мияжапырақ таспа, Cyprepedium calceolus L. – кәдімгі шолпанкебіс, Cyprepedium macranthon Sw. – ірі гүлді шолпанкебіс, Cymbaria daurica L. – даур бақа ауызы, Dactylorhisa fuchsii (Druce) Soo – Фукс сүйсін, Daphne altaica Pall. – алтай бөріжидегі, Drosera rotundifolia L. - теңге жапырақ шықшөп, Erythronium sibiricum (Fisch. et Mey.) Kryl. – сібір қандығы, Epipogium aphyllum (F.W. Schmidt) Sw. – жапырақсыз орашық, Gymnospermium altaicum (Pall.) Spach. – алтай ашықтұқымдысы, Lilium martagon L. – бұйра лалагүл, Macropodium nivale (Pall.) R. Br. – қар долгоногы, Orchis militaris L. – телпек сүйсін, Oxycoccus microcarpus Turcz. - ұсақжеміс мүкжидек, Paeonia anomala L. – кәдімгі таушымылдық, Paeonia hybrida Pall. – гибридті таушымылдық, Paris quadrifolia L. - кәдімгі қарғакөз, Pulsatilla patens (L.) Mill. – ашық кестежусан, Rhaponticum carthamoides (Willd.) Iljin. - маралтамыр, Rheum altaicum Losinsk. – алтай рауғашы, Rhodiola rosea L. – қызғылт семізот, Sanicula europaea L. - еуропа саникуля, Sibiraea altaiensis L. - алтай сибиркасы, Stipa pennata L. – қауырсын қау, Tulipa heteropetalaL. - алакүлтелі қызғалдақ.
Diphasiastrum alpinum (L.) Holub - альпілік дифазиаструм. Мәртебесі - сирек кездесетін, саны қысқарып бара жатқан түр. Тек Алтай мен Саурдың таулы аймақтарынан табылған. Жалпы таралу аймағы - тундра аймағы және Еуразия мен Солтүстік Американың биік таулары. Мәңгі жасыл жайыла өсетін көпжылдық өсімдік. Ол споралармен таралады және спорадан жаңа ересек өсімдік пайда болғанға дейінгі кезең кемінде 5 жыл.
Huperzia selago (L.) Bernh ex Schrank et Mart. - кәдімгі баранец. Мәртебесі - өте сирек кездесетін түрі. Ол Алтай, Жоңғар Алатауының тауларында және Қазақ шоқыларының бір нүктесінде кездеседі. Ол ылғалды жоталарда, тасты шөгінділердің арасында және биік тауда тасты тундрада, сирек орман белдеуінің жоғарғы бөлігінде өседі. Жапырақ қолтықтарында орналасқан споралармен және өнім бүршіктерімен көбейетін мәңгі жасыл көпжылдық шөптесін өсімдік.
Allium pumilum Vved. Bull. Univer. As. Centr. – аласа пияз. Мәртебесі - Алтайдың сирек кездесетін, эндемиктік түрі. Қазақстанда төрт жерден белгілі: олардың екеуі Батыс Алтайда (Иванов жотасы) орналасқан. Қалған екеуі - Үлбі жотасында (қара түйін) және Оңтүстік Алтайда (Бұқтырма өзенінің жоғарғы ағысы) кездеседі. Биік тау криофиттері мен петрофиттті дала мен тундра қауымдастықтарында кездеседі.
Adonis vernalis L. - көктемгі жанаргүл. Мәртебесі - сирек кездесетін түрі. Ол республиканың солтүстігінде және солтүстік-шығысында - Алтай мен Тарбағатайға дейін кездеседі, дегенмен ол Еуропада және Сібірдің оңтүстігінде кең таралған. Көктемде гүлдейтін көпжылдық шөптесін өсімдік. Бұл топырақ талғамайды, жарықтандырылған жерлерге бейімделген, бір дараның тіршілік ету мерзімі 60 жылға жетеді.
Cyprepedium macranthon Sw. - Үлкен гүлді шолпанкебіс. Мәртебесі - сирек кездесетін түр. Сирек түрде шағын топтары Солтүстік Қазақстан мен Алтайда кездеседі. Жапырақты, сирек кездесетін қарағай мен аралас ормандарда, шалғынды дала мен ылғалды шалғындарда өсетін үлкен тамырлы орхидея. Тұқымдарымен көбейеді, жаңаруы әлсіз.
Dactylorhisa fuchsii (Druce) Soo – Фукс сүйсін. Мәртебесі - сирек кездесетін түрі. Бұл Қазақстанның солтүстігінде және Алтайда (оңтүстіктен батыс Алтайға дейін) жекелеген популяциялары кездеседі. Солтүстік тал, қайың, көктерек және аралас ормандарда, орман алқаптарында, өзендер мен бұлақтардың бойында өседі. Мүктердің мол жамылғысы бар дымқыл шалғындарда өздігінен себілетін тұқымдарымен көбейеді.
Daphne altaica Pall. - Алтай бөріжидегі. Мәртебесі - сирек кездесетін, дерлік эндемиктік, реликті түр. Алтай, Тарбағатай, Маңырақ тауларында және Сауырда кездеседі. Тау етегінен орта тауларға дейін тасты беткейлердегі бұталы далаларда өседі. Торғай типіндегі үшінші орман реликтісі (субтропикалық) флорасы. Хош иісті ақ түтікті гүлдері бар сәндік бұта. Тұқымдармен және вегетативті жолмен - тамыр атпаларымен таратылады.
Erythronium sibiricum (Fisch. Et Mey.) Kryl. - Сібірлік қандық. Мәртебесі - сирек кездесетін түр. Ол тек Оңтүстік және Батыс Алтайдың тауларында кездеседі. Ол қылқан жапырақты ормандардың шеттерінде, шалғынды баурайларда, бұталардың арасында, кейде тіпті биік таулы тундраларда да өседі. Ерте гүлдейтін пияз текті көпжылдық өсімдік.
Gymnospermium altaicum (Pall.) Spach. - Алтай ашық тұқымдысы. Мәртебесі - сирек кездесетін, жойылып кету қаупі бар түр. Батыс Алтайдан Тарбағатай мен Жоңғар Алатауы арқылы Іле Алатауы мен Шу-Іле тауларына дейін таралған. Бұл кейде алма және қарағайлы ормандарда, тау етектерінен таулардың жоғарғы белдеуіне дейінгі бұталарда жиі кездеседі. Түйнекті ерте гүлдейтін көпжылдық өсімдік.
Lilium martagon L. - бұйра лалагүл. Мәртебесі - сирек кездесетін түр, саны азайып барады. Алтай, Тарбағатай тауларында және Жоңғар Алатауының солтүстік баурайында кездеседі. Ол дымқыл шөпті шалғындарда, алаңқайларда, қайың, көктерек, балқарағай және сағызқарағай ормандарында өседі.
Macropodium nivale (Pall.) R. Бр. - Қар ұзынаяғы. Мәртебесі - сирек кездесетін, реликті түрлер. Алтай, Сауыр және Тарбағатай тауларының жоғарғы белдеуінде кездеседі. Ол қарлы жартастардың жанында, өзендер мен бұлақтардың жағасында, альпі көгалдарда өседі. Ежелгі түрлер, ол гүл құрылымындағы кейбір қарапайым белгілерімен ерекшеленеді.
Paeonia anomala L. - кәдімгі таушымылдық. Мәртебесі - сирек кездесетін түрі, саны азайып барады. Алтай және Ертіс өзен аңғарының бойындағы тар жолақтан табылған. Жапырақты, аралас және қылқан жапырақты ормандарда, тау бөктері мен таулардың шалғынды және шалғынды беткейлерінде өседі. Неғұрлым үлкен мөлшерімен, біркелкі қалыңдатылған тамырлармен, көптеген сабақтарымен ерекшеленеді.
Paeoni ahybrida Pall. - буданды таушымылдық. Мәртебесі - таралу аймағы қысқарып бара жатқан, дерлік эндемиктік түр. Алтай, Тарбағатай, Сауыр тауларында, Жоңғар Алатауының солтүстік баурайында, сондай-ақ Шығыс шоқыларының іргелес бөлігінде кездеседі. Ол шақпақ тасты және таулы дала беткейлерінде, тау етегінен таулардың орта белдеуіне дейін өседі. Нақты жұмыр түйнек тәрізді тамырларының қалыңдығымен, қысқа бойлығымен және гүлінің ақшыл көк түсті немесе ашық қызғылт түсімен ерекшеленеді.
Pulsatilla patens (L.) Mill. - ашық кестежусан. Мәртебесі - саны азайып бара жатқан түр. Республиканың солтүстік жартысында, соның ішінде Алтай және Тарбағатай тауларында таралған. Ол құрғақ далада, құрғақ шалғындарда, сирек қарағайлы ормандарда және орман жиектерінде, құрғақ беткейлерде, көбінесе құмды және сазды топырақтарда өседі.
Rhaponticum carthamoides (Willd.) Iljin. – маралтамыр. Мәртебесі - саны қатты азайып бара жатқан түр. Алтай тауларында, Тарбағатай мен Жоңғар Алатауында (солтүстік баурайы) кездеседі. Көпжылдық мықты тамырсабақты өсімдік (биіктігі бір метрден асады), ол көбінесе субальпілік шалғындарда, орманды алқаптарда және орман алқаптарында өседі, альпі тундрасына сирек көтеріледі.
Rhodiola rosea L. - қызғылт семізот. Мәртебесі – саны қатты азайып бара жатқан құнды түр. Ол Алтай, Сауыр, Тарбағатай және Жоңғар Алатауының таулы аймақтарында ғана кездеседі. Ол өзен жағасындағы ылғал топырақтарда, ергежейлі балқарағай мен ергежейлі қайыңның тоғайларында, орманның жоғарғы шекарасындағы шалғындарда, жартастар мен тасты беткейлерде, кейде жартасты тундрада өседі.
Rheum altaicum Losinsk. - алтай рауғашы. Мәртебесі – таралу аймағы тарылып бара жатқан, сирек кездесетін түр. Алтай, Тарбағатай мен Сауыр тауларында кездеседі. Қиыршық және тасты құрғақ беткейлерде, кейде шалғындарда және таулардың жоғарғы белдеуіндегі бұталар арасында өседі
Sibiraea altaiensis L. - алтай сибиркасы. Мәртебесі – саны азайып бара жатқан, сирек кездесетін түр. Алтай эндемигі, оның таралуы Алтай аумағынан сәл асады. Үштік жалпақ жапырақты орман қалдығы. Мамыр-маусым айларында гүлдейді, шілде-тамызда жеміс береді. Жапырақтарын кейде шай ретінде, халықтық медицинада безгекті, бауыр ауруын (гепатит), жүрек-тамыр ауруларын емдеуде қолданылады. Сибирка - керемет сәндік өсімдік, қолда тұқымдардан жақсы өседі. Бұл гүлдену кезеңінде ғана емес, сонымен қатар күзде, жапырақтары ашық қызыл түске айналғанда өте тартымды.
Stipa pennata L. - қауырсынды қау. Мәртебесі - бұл саны мен таралуы аймағы азайып бара жатқан түр. Ол дала аймағында - батыс шекарадан бастап Алтай тауларына дейін кеңінен кездеседі. Ол далада, орман жиектерінде және құрғақ тау баурайында өседі. Саздауыттарда аз кездеседі, жеңіл құмды топырақтарға бейім өсімдік. Ол жіңішке жапырақтары мен ұзын (20-40 см) қауырсынды өзектерімен сипатталады.
Tulipa heteropetala L. - алакүлтелі қызғалдақ. Мәртебесі - сирек кездесетін түр. Алтай және Тарбағатай тауларында кездеседі. Ол дала мен шөлейт жерлерде, жиі тау етегінен биік тауларға дейін кездеседі. Популяциялар оқшауланған, әдетте учаскелер бірнеше ондаған шаршы метрді алып жатыр. Тығыздық кейде бір шаршы метрге 10-33 генеративті дараға жетеді.